More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1873 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  61.84 
 
 		 209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  68.05 
 
 		 207 aa  231  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  68.79 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  53.03 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  58.93 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  54.44 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  39.44 
 
 		 150 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.22 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  35.33 
 
 		 226 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  36.81 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.46 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.69 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.15 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.22 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.11 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.9 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  35 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.32 
 
 		 282 aa  92.4  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 		 194 aa  91.7  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  35.14 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  31.45 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  31.13 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.73 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  35.71 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  32.53 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.73 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.13 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  33.12 
 
 		 187 aa  88.6  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.73 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.73 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.73 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.59 
 
 		 260 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.73 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.73 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  31.45 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  31.4 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  31.41 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  34.04 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  32.43 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.33 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  35.29 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  35.46 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  33.53 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  32.93 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.36 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  32.5 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  34.72 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  32.96 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  33.12 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  34.76 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  37.34 
 
 		 195 aa  84.7  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  35.98 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  32.29 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.46 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  32.99 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  33.96 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  33.67 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.9 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  33.67 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  35.06 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.72 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  31.15 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  32.84 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  32.84 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.4 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.41 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32.34 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  33.12 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  30.21 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  31.52 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  29.65 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>