More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0853 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  52.43 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  60.71 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  55.62 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  55.8 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  55.36 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  54.44 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.83 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.59 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  38.24 
 
 		 260 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.73 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.16 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  36.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  35.84 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  31.71 
 
 		 282 aa  96.3  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  39.44 
 
 		 226 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.02 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.06 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  35.54 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  34.75 
 
 		 230 aa  92  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  38.71 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  36.62 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  34.75 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.81 
 
 		 231 aa  90.9  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  38.36 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.52 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.29 
 
 		 202 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  38.62 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.29 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  30.69 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.38 
 
 		 190 aa  87.8  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  36.11 
 
 		 202 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.34 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  35.15 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  35.08 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  33.73 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.17 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.14 
 
 		 226 aa  84.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  34.21 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.96 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  31.61 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  35.98 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  36.2 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  35.22 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  35.46 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  35.46 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  35.88 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.64 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  30.53 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  35.88 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  38.46 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  33.75 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.29 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  35.62 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  34.68 
 
 		 245 aa  81.3  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  34.03 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.34 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.34 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.34 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.34 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  35.15 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.34 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  30.92 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  33.73 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31.87 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  31.32 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  37.16 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.34 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.34 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  36.25 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>