More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1423 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  100 
 
 		 215 aa  440  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  63.74 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  64.38 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  59.76 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  53.03 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  56.82 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  55.36 
 
 		 188 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.92 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  35.18 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  36.62 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.17 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.85 
 
 		 282 aa  99  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36 
 
 		 189 aa  99  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.25 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.25 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  39.13 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  38 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32.94 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  34.1 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.94 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36.53 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.18 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.95 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  32.89 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  35.4 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  36.75 
 
 		 181 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  39.63 
 
 		 175 aa  95.9  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  36.13 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  37.74 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.92 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  35.71 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.28 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  33.51 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  30.54 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.56 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  30.99 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  29.59 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  34.11 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  37.34 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  32.66 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  33.12 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  38.27 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  30.69 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  32.17 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.71 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  30.85 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  33.11 
 
 		 150 aa  88.6  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.48 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  29.07 
 
 		 181 aa  88.6  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.95 
 
 		 200 aa  88.6  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  34.67 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  31.21 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  31.79 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  33.17 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  34.38 
 
 		 261 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  32.77 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  31.54 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  34.38 
 
 		 261 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  32.24 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  31.61 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  33.33 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  32.41 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  32.47 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  29.19 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  31.61 
 
 		 187 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  33.52 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.6 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  30.1 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  34.69 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  34.16 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  31.87 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  32.35 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  32.24 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  32.42 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  33.75 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  35.33 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  31.75 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>