More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1120 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  55.56 
 
 
179 aa  150  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  51.02 
 
 
180 aa  149  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  49.1 
 
 
169 aa  144  6e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  44.1 
 
 
186 aa  144  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  44.12 
 
 
175 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  45.28 
 
 
176 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  45.28 
 
 
176 aa  137  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  50.37 
 
 
173 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  46.67 
 
 
185 aa  131  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  37.79 
 
 
172 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
171 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  37.41 
 
 
171 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  33.16 
 
 
195 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  37.41 
 
 
171 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  36.94 
 
 
207 aa  101  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  35.35 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 
185 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 
200 aa  99  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 
186 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.82 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  37.04 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
196 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
196 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
250 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
196 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
189 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.73 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 
184 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  30.77 
 
 
190 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  33.77 
 
 
245 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  30.61 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  38.41 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.11 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  37.96 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 
189 aa  92  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  38.41 
 
 
180 aa  92.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
178 aa  92  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  36 
 
 
186 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  36 
 
 
189 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 
211 aa  92  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.14 
 
 
189 aa  91.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 
184 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  39.29 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.73 
 
 
228 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
178 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  32.54 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  34.57 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  34.56 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.56 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  35.44 
 
 
181 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  35.95 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  34.56 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
181 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 
200 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  36 
 
 
186 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
181 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 
208 aa  89  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 
208 aa  89  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
181 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  38.75 
 
 
210 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  34.18 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  39.71 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  38.18 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  34.81 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
181 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
181 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  35.2 
 
 
210 aa  87  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  32.39 
 
 
192 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  32.39 
 
 
192 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  31.5 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  36.91 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
190 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  42.19 
 
 
184 aa  87  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  32.39 
 
 
192 aa  87  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>