More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0627 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  35.52 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.9 
 
 		 200 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  38.79 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  38.46 
 
 		 213 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.17 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.5 
 
 		 190 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40.85 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  40 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  39.1 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  37.5 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  41.94 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  41.67 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 210 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  36.41 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  36.32 
 
 		 223 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36.21 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  39.38 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  38.78 
 
 		 207 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  34.94 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  39.29 
 
 		 172 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  35.23 
 
 		 185 aa  99  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  40 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 192 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  35.33 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  33.52 
 
 		 180 aa  98.6  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  36.49 
 
 		 183 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  35.4 
 
 		 174 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 		 192 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  35.8 
 
 		 181 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  39.74 
 
 		 222 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.8 
 
 		 207 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 230 aa  95.1  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  34.97 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  34.21 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  35.43 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  35.38 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  37.84 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  35.43 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.13 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  33.9 
 
 		 186 aa  93.6  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  34.91 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  30.81 
 
 		 217 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  37.24 
 
 		 190 aa  92.8  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 188 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  30.99 
 
 		 194 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  38.36 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  33.51 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 199 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  37.75 
 
 		 202 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.42 
 
 		 194 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  37.11 
 
 		 209 aa  92.4  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  38.69 
 
 		 193 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  34.59 
 
 		 195 aa  92  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  38.1 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  35.25 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  31.28 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  35.97 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  34.5 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  39.85 
 
 		 181 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 		 194 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  34.21 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  36.48 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  30.73 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  39.39 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 		 186 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  40.44 
 
 		 191 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  35.9 
 
 		 169 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  37.06 
 
 		 178 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.23 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  36.91 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.92 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.51 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  31.22 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  31.5 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>