More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0528 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  100 
 
 
193 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  70.68 
 
 
240 aa  259  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  68.82 
 
 
218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  52.34 
 
 
267 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  54.3 
 
 
193 aa  187  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  67.16 
 
 
222 aa  185  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  62.32 
 
 
299 aa  184  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  63.91 
 
 
298 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  61.59 
 
 
265 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  48.57 
 
 
250 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  54.12 
 
 
271 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  51.14 
 
 
264 aa  174  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  46.26 
 
 
235 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  54.27 
 
 
278 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  50.81 
 
 
217 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  45.93 
 
 
228 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  47.34 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  41.67 
 
 
209 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  45 
 
 
235 aa  141  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  49.51 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  51.52 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  43.81 
 
 
209 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  44.44 
 
 
205 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  42.86 
 
 
215 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  42.86 
 
 
215 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  48.06 
 
 
232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  42.31 
 
 
215 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  44.64 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  47.3 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  39.22 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  47.83 
 
 
199 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  42.86 
 
 
232 aa  122  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  43.31 
 
 
218 aa  122  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  44.14 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.91 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.38 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  37.24 
 
 
214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.78 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  39.57 
 
 
213 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 
242 aa  99  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  37.42 
 
 
223 aa  97.8  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.73 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  39.55 
 
 
286 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.4 
 
 
207 aa  94.4  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  39.1 
 
 
261 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  39.1 
 
 
261 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  38.73 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  32.82 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 
208 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 
208 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  34.64 
 
 
246 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.14 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  37.5 
 
 
207 aa  89  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.31 
 
 
200 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  37.14 
 
 
172 aa  88.6  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  34.23 
 
 
226 aa  88.6  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.33 
 
 
231 aa  88.6  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  35.57 
 
 
218 aa  88.2  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  31.96 
 
 
194 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  32.06 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.66 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.72 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.36 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  34.32 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  33.07 
 
 
195 aa  84.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  33.77 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.65 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  33.08 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  37.04 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.69 
 
 
260 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  35.61 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  32.21 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  31.69 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  31.69 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.45 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  30.59 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  30.59 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  30.59 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  30.59 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  30.59 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  33.33 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.97 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>