More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6904 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  64.14 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  59.46 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  54.05 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  52.74 
 
 		 211 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  47.78 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  48.95 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  42.08 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  47.52 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  41.22 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  40.44 
 
 		 202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  41.94 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.77 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.36 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  38.1 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  34.29 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.81 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  36.81 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  33.89 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  38.51 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 		 195 aa  97.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  34.42 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.37 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  33.55 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 		 248 aa  94.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  38.19 
 
 		 204 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  36.9 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.54 
 
 		 223 aa  91.7  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  32.37 
 
 		 224 aa  91.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  35.57 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  30.41 
 
 		 239 aa  90.9  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  35.92 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  33.33 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  29.89 
 
 		 239 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  33.12 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 		 242 aa  89.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.91 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  33.33 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 209 aa  88.2  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  34.42 
 
 		 209 aa  87.8  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  34.38 
 
 		 286 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  30.22 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  31.77 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  31.67 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  33.33 
 
 		 260 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  35.81 
 
 		 261 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  35.81 
 
 		 261 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.54 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  32.77 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  30.32 
 
 		 247 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  31.43 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  32.43 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  32.34 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  29.24 
 
 		 239 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  32.35 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  31.97 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.57 
 
 		 243 aa  85.1  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  31.29 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  37.04 
 
 		 198 aa  84.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  38 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.11 
 
 		 282 aa  84.7  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.87 
 
 		 246 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.26 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  28.26 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  31.37 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  35.23 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  29.76 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  34.25 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  29.61 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  31.79 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  30.23 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  31.41 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  32.12 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.11 
 
 		 217 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  35.33 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  32.26 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.04 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  32.62 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  31.37 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0439  GrpE protein  34.27 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00290609  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  32 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  32.69 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  34.25 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  30.51 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  31.65 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  31.08 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  34.13 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34.18 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  28.86 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  33.08 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>