More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1343 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  97.3 
 
 		 259 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  80.56 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  73.44 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  71.28 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  77.44 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  76.22 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  71.75 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  76.22 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  76.83 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  57.53 
 
 		 207 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  48.48 
 
 		 223 aa  185  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  47.76 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  52.15 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  43.88 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  43.88 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  56.93 
 
 		 242 aa  175  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  50.34 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  35.8 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  34.97 
 
 		 197 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  37.06 
 
 		 204 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  37.69 
 
 		 225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.52 
 
 		 226 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  38.85 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.71 
 
 		 190 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.94 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.57 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  38.82 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  37.09 
 
 		 204 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  40.74 
 
 		 204 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  37.01 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.53 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.24 
 
 		 231 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  38.51 
 
 		 169 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  37.78 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  36.05 
 
 		 185 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  33.33 
 
 		 192 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.36 
 
 		 181 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  33.17 
 
 		 202 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  32.37 
 
 		 200 aa  95.9  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  34.39 
 
 		 183 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.67 
 
 		 217 aa  95.5  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.33 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 192 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.5 
 
 		 198 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 208 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 208 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  31.55 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 		 198 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.68 
 
 		 207 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 206 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  37.59 
 
 		 178 aa  92.8  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  36.76 
 
 		 203 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 201 aa  92.8  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  33.81 
 
 		 211 aa  92.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  35.81 
 
 		 184 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  37.41 
 
 		 198 aa  92  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  36.92 
 
 		 192 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  32.09 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  35.25 
 
 		 206 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 		 195 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  37.93 
 
 		 180 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.39 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  36.76 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  32.37 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  28.8 
 
 		 200 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  27.47 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  29.48 
 
 		 179 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  33.12 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 		 200 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  31.79 
 
 		 172 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  29.79 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  30.94 
 
 		 191 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.73 
 
 		 189 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  32.19 
 
 		 201 aa  86.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  30.77 
 
 		 180 aa  85.5  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 201 aa  85.5  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  35.37 
 
 		 187 aa  85.1  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  31.48 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  32 
 
 		 205 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  30.27 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  28 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  32 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  32.37 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  28.73 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>