More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08251 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  66.47 
 
 		 192 aa  230  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  56.25 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  53.11 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  47.22 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  43.16 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  47.37 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  48.99 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  38.22 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.16 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  40.25 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  38.24 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  34.46 
 
 		 190 aa  98.2  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  32.31 
 
 		 213 aa  97.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  36.02 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  32.37 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  33.8 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  33.8 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.18 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  37.34 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.34 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  30.64 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  36.02 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.82 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  32.47 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  33.56 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  39.71 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  34.18 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  32.64 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  36.03 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  36.36 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  34.13 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  32.47 
 
 		 225 aa  85.5  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  33.53 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.56 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  32.12 
 
 		 173 aa  85.1  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  29.9 
 
 		 246 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.71 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  29.45 
 
 		 248 aa  84.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  29.45 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.82 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  34.09 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.26 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  32 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  35.22 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  34.33 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  30.48 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  35.57 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  30.56 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  31.97 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  31.97 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  33.09 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  31.76 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  34 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  34.46 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  32.69 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  33.12 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.33 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  32.19 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  30.73 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  32.24 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  34.46 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  33.57 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  37.42 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  32.12 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  31.22 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.93 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  33.56 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  34.32 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0096  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  31.37 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  31.37 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.92 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  28.65 
 
 		 239 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  31.77 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  31.28 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  34.38 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  27.74 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  33.56 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  34.1 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>