More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  69.01 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  56.63 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  55.28 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  33.33 
 
 		 210 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.51 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 		 198 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  37.8 
 
 		 188 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  37.8 
 
 		 188 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  36.78 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  37.35 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  37.35 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  37.35 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  37.35 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  37.35 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  39.29 
 
 		 194 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  36.94 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.13 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  34.52 
 
 		 189 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 192 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 189 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 204 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 198 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.45 
 
 		 190 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 206 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 203 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 187 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 187 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 206 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 206 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  36.99 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 206 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 206 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 		 200 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 203 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.66 
 
 		 194 aa  95.5  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  32.02 
 
 		 189 aa  95.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.07 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 189 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  34.43 
 
 		 204 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  33.79 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  34.04 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  32.75 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  41.73 
 
 		 172 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.5 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  38.03 
 
 		 191 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.91 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  34.93 
 
 		 181 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  34 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  38.35 
 
 		 192 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  38.69 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  40.29 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  31.28 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  35.21 
 
 		 184 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  31.39 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 199 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  34.51 
 
 		 184 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  35.33 
 
 		 209 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 		 191 aa  89  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.03 
 
 		 210 aa  89.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  35.17 
 
 		 185 aa  89  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  40.46 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 208 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 208 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  35.48 
 
 		 210 aa  88.6  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  33.08 
 
 		 201 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 172 aa  88.6  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  36.53 
 
 		 187 aa  88.6  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.76 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  28.92 
 
 		 195 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36 
 
 		 201 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  36.91 
 
 		 187 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  36.69 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  34.93 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  34.83 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 		 185 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  33.99 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  30.29 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  34.44 
 
 		 184 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  29.8 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  33.11 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 		 186 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  26.09 
 
 		 225 aa  85.5  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  32.9 
 
 		 228 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>