More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1459 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  44.85 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  42.68 
 
 
213 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  41.3 
 
 
181 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 
172 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 
200 aa  104  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  37.58 
 
 
192 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 
200 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  45.45 
 
 
189 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 
172 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  41.01 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  35.58 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.13 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  40.27 
 
 
246 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  32.39 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.13 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.69 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  36.87 
 
 
181 aa  94.7  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  42.14 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  34.94 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 
248 aa  93.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  35.12 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  36.76 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  41.67 
 
 
261 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  37.11 
 
 
244 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  41.67 
 
 
261 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  37.85 
 
 
186 aa  92  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 
200 aa  92  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 
201 aa  92  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.91 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  43.45 
 
 
286 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  42.96 
 
 
223 aa  91.7  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.52 
 
 
186 aa  92  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
209 aa  91.3  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  41.67 
 
 
210 aa  91.7  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 
171 aa  91.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  36.31 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 
206 aa  91.3  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  33.14 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 
201 aa  91.3  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  32.94 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  37.32 
 
 
217 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  32.94 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  38.51 
 
 
231 aa  89  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  34.68 
 
 
274 aa  89  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.24 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  39.55 
 
 
194 aa  89  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 
203 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 
206 aa  88.2  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  34.48 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  36.61 
 
 
185 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 
195 aa  87.8  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  31.32 
 
 
184 aa  87.8  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  36.22 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  34.94 
 
 
194 aa  87.4  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  39.19 
 
 
206 aa  87.8  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  32.02 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  36.05 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 
203 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  33.81 
 
 
195 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  36.55 
 
 
172 aa  87  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  38.13 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
192 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  36.3 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.07 
 
 
243 aa  86.3  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.23 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  36.02 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  36.07 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  32.64 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  37.2 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  38.97 
 
 
224 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.02 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.14 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  32.5 
 
 
213 aa  85.1  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>