More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  100 
 
 		 243 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  57.89 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  53.22 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  56.63 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.34 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  42.28 
 
 		 192 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.59 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  38.06 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  37.14 
 
 		 213 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  38.46 
 
 		 198 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  38.13 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  43.14 
 
 		 180 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  37.97 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  41.29 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  37.66 
 
 		 204 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  41.26 
 
 		 194 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  37.75 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  35.98 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.24 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.01 
 
 		 181 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  35.8 
 
 		 178 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  38.56 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40.3 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  38.18 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  35.34 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.36 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  37.91 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 186 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.35 
 
 		 202 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  40.29 
 
 		 172 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  34.2 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  31.89 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.2 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.67 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  36.02 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  36.46 
 
 		 191 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 200 aa  99  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  40.41 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  37.41 
 
 		 194 aa  98.6  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  33.75 
 
 		 181 aa  98.6  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  38.69 
 
 		 172 aa  98.2  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.68 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  32.89 
 
 		 187 aa  98.2  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  36.5 
 
 		 186 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  28.45 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  36.55 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.8 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  35.95 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  39.39 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  35.57 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.07 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  32.47 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.99 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  32.47 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  39.85 
 
 		 198 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  36.13 
 
 		 185 aa  95.5  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  36.62 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  35.18 
 
 		 188 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  35.18 
 
 		 188 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  35.18 
 
 		 188 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  35.18 
 
 		 188 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  35.18 
 
 		 188 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.9 
 
 		 181 aa  95.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  34.48 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  36.76 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  25 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  38.35 
 
 		 192 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.12 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.86 
 
 		 189 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  29.63 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 192 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  31.76 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  38.93 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  36.11 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 		 195 aa  93.6  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32.67 
 
 		 197 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  34.25 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  37.84 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>