More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0212 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  71.35 
 
 		 191 aa  249  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  47.1 
 
 		 218 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.65 
 
 		 208 aa  97.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  40.44 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  39.53 
 
 		 200 aa  91.3  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  38.73 
 
 		 156 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  33.14 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  33.33 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  33.33 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.93 
 
 		 282 aa  87.8  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  35.71 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  34.81 
 
 		 226 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  32.77 
 
 		 217 aa  87  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  33.33 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  36.36 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  31.47 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  35.96 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.9 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  35.97 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  30.51 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.72 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  33.77 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  35.09 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  36.57 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  31.36 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.33 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  33.33 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  34.16 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  32.22 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  36.84 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  34.86 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  33.14 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  35.81 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.27 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  31.87 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  37.31 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  32.92 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  34.64 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  35.77 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  32.93 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  32.41 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.33 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  34.68 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  32.45 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  33.74 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  31.95 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  31.74 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  30.97 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  31.74 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  33.77 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  33.97 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.45 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  33.92 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  32.35 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  30.39 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0439  GrpE protein  37.25 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00290609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  35.1 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  34.27 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.8 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  37.27 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  33.33 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  29.52 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  34.44 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  35.86 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  31.21 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  35.07 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  36.11 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  34.73 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  32.69 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  34.44 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  32.52 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  30.57 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  32.74 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  28.89 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.51 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>