More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1087 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  63.74 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  68.05 
 
 		 207 aa  231  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  60.54 
 
 		 198 aa  227  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  54.13 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  60.8 
 
 		 206 aa  224  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  55.62 
 
 		 188 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.78 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.42 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.03 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  35.8 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  35.47 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  32.06 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  35.46 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.12 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.57 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.67 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.52 
 
 		 282 aa  99.8  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  35.37 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  38.75 
 
 		 188 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.26 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  35.19 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.71 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  32.5 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.12 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  32.96 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  32.89 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.46 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  31.45 
 
 		 226 aa  94.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.04 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  34.51 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  31.87 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  31.4 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.27 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.27 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  33.33 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  36.21 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  36.21 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  29.65 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  36.21 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  36.21 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.38 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  36.21 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  36.21 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  36.21 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.5 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  35.48 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.63 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.2 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  32.39 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  30.92 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  32.45 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  35.63 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  32.68 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  33.33 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  35.62 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  32.88 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  33.12 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  36.41 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  34.09 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  28.34 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  31.97 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  31.32 
 
 		 242 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  35.03 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  36.03 
 
 		 224 aa  88.2  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.72 
 
 		 197 aa  88.2  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  34.32 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  32.41 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  35.03 
 
 		 175 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  34.32 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  33.51 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 241 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  35.53 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>