More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1347 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  100 
 
 
150 aa  290  5e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  39.44 
 
 
207 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  34.44 
 
 
198 aa  98.6  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.87 
 
 
200 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  33.79 
 
 
188 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  37.93 
 
 
226 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  36.69 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  37.24 
 
 
181 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  31.79 
 
 
209 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  36.3 
 
 
198 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  34 
 
 
206 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  32.45 
 
 
207 aa  90.5  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  38.36 
 
 
188 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.44 
 
 
217 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  38.24 
 
 
224 aa  88.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  33.11 
 
 
215 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  35.33 
 
 
184 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.05 
 
 
213 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  34.29 
 
 
187 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  36.49 
 
 
201 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  34.29 
 
 
187 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  34.72 
 
 
186 aa  87  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32.73 
 
 
202 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.73 
 
 
202 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  33.57 
 
 
187 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 
195 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  31.47 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  32.14 
 
 
185 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  31.29 
 
 
185 aa  84.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.97 
 
 
204 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  34.29 
 
 
183 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  41.67 
 
 
178 aa  84.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  31.21 
 
 
201 aa  84.3  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  36.73 
 
 
204 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  31.03 
 
 
191 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
210 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 
208 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  31.97 
 
 
179 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  29.45 
 
 
173 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  35.66 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  33.56 
 
 
226 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  36.49 
 
 
206 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  32.88 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  32.43 
 
 
260 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  37.23 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  30.87 
 
 
204 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  32.65 
 
 
218 aa  80.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 
208 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  33.33 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  32.03 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  35.25 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  29.03 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  32.64 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  31.25 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  27.81 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  27.81 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  29.3 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  36.5 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 
207 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 
208 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.17 
 
 
207 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  28.48 
 
 
282 aa  77  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  32.35 
 
 
202 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 
208 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  33.78 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.36 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  27.63 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  35.37 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.89 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  26.14 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  29.37 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  33.57 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  29.22 
 
 
247 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 
248 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  31.72 
 
 
211 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 
199 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  35.82 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0439  GrpE protein  31.33 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00290609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  32.24 
 
 
213 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.11 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  33.08 
 
 
188 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 
259 aa  73.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  34.19 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 
259 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  33.12 
 
 
221 aa  73.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  30.82 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.45 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  34 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  30.82 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  34.78 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  29.17 
 
 
237 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>