More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2077 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  46.45 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  47.1 
 
 
184 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.31 
 
 
208 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  40.74 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.77 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.41 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.82 
 
 
243 aa  95.5  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  30.88 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 
222 aa  92  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  37.66 
 
 
218 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.33 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  36.99 
 
 
173 aa  89.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  33.75 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 
194 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  30.05 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 
192 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 
198 aa  88.6  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  35.57 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  34.44 
 
 
222 aa  88.2  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  38.13 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.87 
 
 
200 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  30.54 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 
198 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 
194 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  31.18 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  35.38 
 
 
186 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  37.75 
 
 
181 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  31.18 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  31.18 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 
189 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  34.67 
 
 
181 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
185 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 
195 aa  84.7  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  33.55 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  36.64 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  33.97 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  29.67 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  29.63 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  28.57 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  33.56 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  32.62 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  37.33 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  32.28 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  34.18 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  32.88 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  35.03 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  31.91 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.31 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  35.57 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 
195 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  38.78 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  36.73 
 
 
184 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  33.57 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 
189 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  37.8 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  32.61 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  37.58 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  32.81 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  30.66 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  32.73 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>