More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1182 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  89.3 
 
 		 187 aa  353  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  89.3 
 
 		 187 aa  347  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  44.37 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  44.16 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  40 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  39.51 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  39.13 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.33 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  39.47 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.44 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  35.62 
 
 		 231 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0439  GrpE protein  40.13 
 
 		 171 aa  95.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00290609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  31.87 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.43 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  34.27 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  33.33 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  29.63 
 
 		 206 aa  90.9  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.67 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  37.01 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  34.57 
 
 		 221 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  31.74 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  33.33 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  31.4 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  30.16 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  36.55 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  33.57 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  33.55 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.47 
 
 		 282 aa  85.1  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.71 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  31.61 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.1 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.97 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.93 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.93 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  32.61 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  31.11 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  33.99 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  32.61 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  28.12 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  28.57 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  28.07 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  30.59 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  30.67 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  31.58 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  30.43 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  34.09 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  35.16 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  31.41 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  31.17 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  31.58 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  28.75 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  32.26 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  31.58 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  31.58 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.14 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.14 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  29.93 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  33.13 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  34.67 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  29.82 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  31.98 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  32.7 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  32.03 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  36.15 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  29.94 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  31.29 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  31.29 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  32.03 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  29.41 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  30.97 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  29.23 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  29.46 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  32.21 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  38.16 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.53 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  28.24 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  31.62 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  29.73 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  27.66 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  30.77 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.51 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  33.79 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  29.23 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  28.68 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  28.68 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  28.68 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  28.68 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  28.68 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  30.72 
 
 		 241 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  30 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  32.67 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  30.72 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  29.78 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  30.72 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>