More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4806 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  100 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  46.26 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  50.99 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  43.41 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  57.04 
 
 		 299 aa  158  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  43.12 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  44.98 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  56.72 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  45.85 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  45.85 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  45.37 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  52.27 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  42.37 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  43.75 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  45.15 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.57 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  50.47 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  43.5 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  41.8 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.32 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  42.58 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  47.01 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  43.07 
 
 		 278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  39.6 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  39.32 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  51.32 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  39.81 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  44.85 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  36.23 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.48 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.38 
 
 		 188 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  45.27 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.65 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  34.86 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  36.53 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  36.69 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  31.9 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  31.9 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.21 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.55 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  32.35 
 
 		 248 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  32.14 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  34.06 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  29.67 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  34.06 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.39 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  34.94 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.94 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  34.94 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.17 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  33.09 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.3 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  31.58 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  33.09 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  22.65 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  32.84 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  28.48 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30.95 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  31.65 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  33.13 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  32.9 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  31.76 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  32.58 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  35.21 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  30.23 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  32.03 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  31.74 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.26 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  28.18 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  33.09 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  27.95 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.86 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  28.32 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  31.54 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  28.32 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  31.3 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  26.34 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  31.34 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.08 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  30.92 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  26.83 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  29.5 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.56 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  27.07 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  31.01 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  31.25 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  27.47 
 
 		 190 aa  72  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  32.06 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  29.86 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  31.78 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  30.6 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  29.17 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  27.97 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>