More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  64.89 
 
 		 199 aa  214  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  53.8 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  57.14 
 
 		 193 aa  160  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  48.34 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  47.97 
 
 		 232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  48.61 
 
 		 218 aa  150  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  47.65 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  55 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  54.86 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  51.55 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  48.06 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  46.15 
 
 		 299 aa  131  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  45.77 
 
 		 222 aa  131  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  44.16 
 
 		 298 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  47.37 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  44.37 
 
 		 265 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  43.2 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  43.2 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  50.72 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  42.01 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  44.03 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.61 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  48.91 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  42.55 
 
 		 267 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.84 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  40 
 
 		 250 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  40.79 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  42.18 
 
 		 214 aa  111  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.29 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  44.36 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  45.04 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  41.41 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.77 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  46.48 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.44 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  42.52 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  46.71 
 
 		 278 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  40.54 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.57 
 
 		 207 aa  90.9  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.32 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.29 
 
 		 282 aa  86.3  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  36.02 
 
 		 179 aa  84.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  30.14 
 
 		 226 aa  84.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  33.51 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  38.06 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  32.41 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.36 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1291  GrpE protein  39.85 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  35.16 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.81 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  34.21 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.91 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  37.1 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  37.1 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  29.34 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  38.1 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  32.17 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.24 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.99 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  36.14 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  36.31 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  32.87 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  32.47 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  30.47 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  32.54 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  32.48 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  30.47 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.4 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.86 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  35.95 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  36.15 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  30.92 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  35.03 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.42 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  32.48 
 
 		 207 aa  72  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  32.16 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  30.86 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  34.01 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  31.29 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  34.97 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 230 aa  72  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  33.8 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  35.16 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>