More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0350 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  61.5 
 
 		 188 aa  214  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  55.35 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  57.04 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  50.7 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  46.91 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  48.95 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  46.25 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  44.44 
 
 		 267 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  51.57 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  50.39 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  52.48 
 
 		 209 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  50.78 
 
 		 299 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  50.78 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  49.25 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  45.27 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  51.45 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  45.07 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  52.38 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  52.34 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  48.12 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  48.12 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  48.12 
 
 		 215 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  47.93 
 
 		 298 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  38.66 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.23 
 
 		 264 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  42.07 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  50.34 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  45.67 
 
 		 250 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  45.11 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  43.84 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.97 
 
 		 224 aa  111  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  50.4 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  46.09 
 
 		 271 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.02 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  37.59 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  50.78 
 
 		 278 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.53 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.46 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  31.45 
 
 		 226 aa  95.9  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  37.11 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  38.04 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  32.35 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  30.94 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  30.35 
 
 		 242 aa  84.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  36.36 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  29.7 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  32.08 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.12 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  29.27 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  33.08 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  28.72 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.16 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  31.54 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30.2 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.3 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.05 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  31.47 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  37.3 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  33.08 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  31.46 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  28.5 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.11 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  37.68 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.88 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  29.27 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  35.88 
 
 		 274 aa  74.7  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  29.27 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  28.48 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  34.35 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  34.46 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  35.61 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  34.68 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  35.2 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  34.81 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  33.11 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  28.72 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  30 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  30.85 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  34.13 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  30.52 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  32.26 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  32.91 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1291  GrpE protein  34.85 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  27.48 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  34.88 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  32.21 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  25.84 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.33 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  32.05 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  33.59 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  31.37 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  33.33 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>