More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4269 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  52.38 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  50.49 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  50 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  50 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  52.08 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  49.25 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  58.65 
 
 		 199 aa  158  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  42.58 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  44.02 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  41.59 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  43.9 
 
 		 278 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  37.44 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  36.59 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  35.44 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  37.24 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  39.47 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  46.67 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  44.44 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  37.5 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  37.68 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  42.36 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.16 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  43.94 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  41.12 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  39.29 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  35.86 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  36.17 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.58 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  40.74 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.1 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.67 
 
 		 188 aa  99  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  35.64 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  38.19 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  37.18 
 
 		 282 aa  91.3  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.46 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.84 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.84 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  37.59 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.76 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  36.15 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  38.81 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  30.39 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.29 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  35.97 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.01 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.39 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  28.25 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  33.85 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.92 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  39.23 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  40.56 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  35.04 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.46 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  32.83 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  37.78 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  28.78 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  34.67 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.76 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  34.81 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  28.44 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  31.86 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  33.53 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  35.53 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.33 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  32.82 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  33.11 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.79 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  32.64 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  29.94 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  34.56 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  34.5 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.33 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  33.7 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  29.38 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  36.88 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.11 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  33.12 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.11 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  33.12 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  33.77 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  36.97 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  33.09 
 
 		 172 aa  72  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>