More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4362 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  100 
 
 		 212 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  52.38 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  51.49 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  45.03 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  44.19 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  41.3 
 
 		 298 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  50 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  50 
 
 		 265 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  48.51 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  44.44 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  44.85 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  48.51 
 
 		 267 aa  118  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.74 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  43.31 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  41.86 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  41.36 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  45.11 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  47.73 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  46.43 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  46.43 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  49.25 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  45.71 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  46.67 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  45.45 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  35 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  40.78 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  43.82 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  42.03 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.41 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  41.35 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.42 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  44.85 
 
 		 261 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.39 
 
 		 188 aa  89  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  44.68 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  46.32 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  42.96 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  31.84 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.51 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.95 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  30.85 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  35.46 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  30.77 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  36.17 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  30.99 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  34.97 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  31.46 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  29.02 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  32.68 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  30.73 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  28.99 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  34 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  29.08 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.43 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  34.85 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  28.48 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.89 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  28.88 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  29.41 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  35.86 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  24.88 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  32.12 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  29.41 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  28.76 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  33.58 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  33.59 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  32.12 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  31.13 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  31.37 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  29.45 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  30.15 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  24.86 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  27.33 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  29.79 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  27.65 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  32.67 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  30.73 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  32 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  31.95 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  32.67 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  32.62 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  29.85 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  30.77 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  32.17 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  32.17 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0439  GrpE protein  32.03 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00290609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  30.34 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  29.93 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>