More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5217 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  52.02 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  50.47 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  48.06 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  43.06 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  56.25 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  47.21 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  46.15 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  57.75 
 
 		 299 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  46.6 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  46.88 
 
 		 215 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  46.88 
 
 		 215 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  45.98 
 
 		 215 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  45.59 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  55.64 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  44.95 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  51.09 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  46.15 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  44.62 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  44.55 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  44.12 
 
 		 205 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  41.95 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  41.12 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  47.97 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  51.39 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  54.01 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  42.5 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.91 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  39.45 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.31 
 
 		 220 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  42.34 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  38.79 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  42.96 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  38.43 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.41 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  42.45 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  38.73 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  37.74 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  38.04 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.33 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  36.69 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.42 
 
 		 172 aa  92.8  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.74 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  41.43 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  38 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  31.72 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.63 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  32.4 
 
 		 189 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.73 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  34.62 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  30.67 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  36.73 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  36.75 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  29.38 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.5 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  30.18 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.65 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  34.23 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  31.13 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.76 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  33.82 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  31.6 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.56 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  31.01 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  37.59 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  35.76 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  34.44 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  33.56 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  30.11 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  30.11 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  27.04 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  33.59 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  30.11 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  30.32 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  35.12 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  30.11 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  30.16 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  30.11 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  31.54 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30.88 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  28.66 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  28.76 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35.26 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  31.06 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.23 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  39.23 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  27.63 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  33.81 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  33.57 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  27.63 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  34.52 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>