More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2116 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  100 
 
 
267 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  55.09 
 
 
218 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  52.15 
 
 
240 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  52.34 
 
 
193 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  58.17 
 
 
222 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  55.21 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  56.94 
 
 
299 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  45.16 
 
 
250 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  49.01 
 
 
264 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  44.57 
 
 
271 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  55.88 
 
 
193 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  44.58 
 
 
235 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  47.09 
 
 
298 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  48.59 
 
 
217 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  43.26 
 
 
278 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  46.91 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  41.36 
 
 
217 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  44.83 
 
 
199 aa  125  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  39.32 
 
 
209 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  39.64 
 
 
228 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  39.09 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  37.7 
 
 
215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  48.51 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  37.7 
 
 
215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  41.88 
 
 
235 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  37.7 
 
 
215 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.84 
 
 
224 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  45.65 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  36.32 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
218 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  39.55 
 
 
205 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  47.37 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  41.2 
 
 
206 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.28 
 
 
208 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.98 
 
 
261 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.74 
 
 
188 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  39.5 
 
 
205 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.44 
 
 
226 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.5 
 
 
220 aa  102  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.26 
 
 
207 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.93 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.95 
 
 
172 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  38.06 
 
 
214 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  36.54 
 
 
197 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  35.29 
 
 
172 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  27.98 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  33.33 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  33.71 
 
 
194 aa  86.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  31.35 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  31.98 
 
 
223 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  29.55 
 
 
187 aa  85.5  9e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.37 
 
 
195 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.22 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  33.87 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  31.25 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  36.53 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  33.85 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  29.44 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.7 
 
 
189 aa  81.6  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  34.36 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.17 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  32.5 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.87 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.06 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.97 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  30.67 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  34 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  30.92 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.25 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  30.92 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.12 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  31.65 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  35.57 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  25.12 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  35.14 
 
 
172 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  34.32 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  35.85 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  29.87 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  33.56 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  30.77 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  30.77 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  29.27 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  33.33 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  30.34 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
200 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  32.9 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  30.77 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  30.97 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  31.28 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  31.11 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  28.86 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  30.3 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  31.82 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  27.23 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  30.08 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>