More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1281 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  100 
 
 		 232 aa  463  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  65.37 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  53.57 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.92 
 
 		 188 aa  131  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  37.13 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  47.66 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  42.86 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  40.28 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  43.9 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  39.86 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  42.06 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  38.3 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  36.61 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  40.94 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  39.57 
 
 		 193 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.73 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  39.42 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  41.22 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  42.36 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  41.73 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  38.33 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  40.34 
 
 		 298 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  41.67 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  34.76 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  38.97 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  38.57 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  38.57 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  38.57 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.74 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.75 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  38.89 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.26 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  37.01 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  35.97 
 
 		 271 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  38.13 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.43 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  43.41 
 
 		 278 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.43 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  31.65 
 
 		 191 aa  85.5  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  35.53 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  36.69 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.42 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  32.41 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  32.41 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.74 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  35.75 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30.99 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  31.82 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  32.41 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  35.77 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  31.28 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.37 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  31.13 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  29.25 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  28.34 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  28.5 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  31.88 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  32 
 
 		 179 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  29.63 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  32.47 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  33.33 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  33.33 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  29.5 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  35.17 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  29.92 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  31.54 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  34.93 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  33.8 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.33 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  28.08 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  30.41 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  31.51 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  29.45 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  28.83 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  29.05 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  34.4 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  33.33 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  28.28 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  34.75 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  32.31 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  31.43 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  31.82 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  33.08 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.69 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  32.62 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  32.09 
 
 		 187 aa  72  0.000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  32.62 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  26.73 
 
 		 259 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  28.9 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  34.4 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  26.67 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  31.39 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  31.01 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  30.2 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>