More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0197 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  57.67 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  51.91 
 
 		 218 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  55.85 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  54.45 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  48.42 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  51.04 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  56 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  46.76 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  45.83 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  46.81 
 
 		 193 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  56.93 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  44.5 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  52.87 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  46.49 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  43.37 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  40.97 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  49.23 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  40.83 
 
 		 232 aa  136  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  49 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  42.21 
 
 		 206 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.44 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  44.29 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  47.92 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.28 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  41.96 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  41.96 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  41.96 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  40.18 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  40.54 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  42.35 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.61 
 
 		 188 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  48.23 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.4 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  37.17 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  43.66 
 
 		 199 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.48 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.01 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  37.64 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.41 
 
 		 243 aa  95.9  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  32.63 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.21 
 
 		 194 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  30.39 
 
 		 187 aa  93.6  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.33 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  37.59 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  35.71 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.33 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  37.5 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.33 
 
 		 190 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  34.36 
 
 		 185 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.58 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  34.69 
 
 		 203 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  32.69 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  32.69 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  32.69 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  37.41 
 
 		 177 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  32.93 
 
 		 181 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.77 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 201 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  34.09 
 
 		 180 aa  86.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.29 
 
 		 172 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  33.83 
 
 		 189 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.85 
 
 		 181 aa  85.9  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.69 
 
 		 213 aa  86.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  34.78 
 
 		 204 aa  85.9  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  33.7 
 
 		 189 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  34.44 
 
 		 183 aa  85.5  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  30.81 
 
 		 207 aa  85.5  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  32.93 
 
 		 195 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  33.12 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  30.1 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  33.74 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36.42 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.05 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  32.41 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34.64 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  36.3 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  30.95 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  27.98 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  34.2 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  36.15 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  32.45 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  32.54 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  31.69 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  32.81 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  37.97 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  32.29 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  32.9 
 
 		 173 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  35.14 
 
 		 186 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  36.02 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  37.97 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  29.35 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.2 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  35.81 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>