More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  100 
 
 		 261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  56.25 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  49.03 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  46.85 
 
 		 218 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  48.18 
 
 		 215 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  48.18 
 
 		 215 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  48.18 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  50.49 
 
 		 193 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  49.53 
 
 		 209 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  44.44 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  45.12 
 
 		 205 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  59.29 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  49.76 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  56.55 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  50.3 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  47 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  51.09 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  43.14 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  48.95 
 
 		 222 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.86 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  52.7 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  42.56 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  46.11 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  43.33 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  45.41 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  40 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.74 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  40.59 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  43.67 
 
 		 199 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  50 
 
 		 188 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  38.28 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.08 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  39.2 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  44.85 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  38.07 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  44.72 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  36.09 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.94 
 
 		 223 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.35 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.21 
 
 		 208 aa  99  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  35.17 
 
 		 208 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  37.82 
 
 		 207 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  35.17 
 
 		 208 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.26 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  35.37 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  35.37 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  35.27 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.81 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  31.63 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  36.24 
 
 		 172 aa  92  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  36.36 
 
 		 178 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.79 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  36.99 
 
 		 172 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  37.04 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  33.33 
 
 		 189 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 194 aa  88.6  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  29.83 
 
 		 190 aa  88.6  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.55 
 
 		 194 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  29.89 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  38.93 
 
 		 201 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  37.3 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.81 
 
 		 192 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  32.95 
 
 		 181 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  29.89 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 200 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.88 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.76 
 
 		 195 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  37.21 
 
 		 207 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  34.46 
 
 		 210 aa  85.5  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  31.78 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  27.11 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  36.47 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  35.16 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  34.88 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  32.53 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  28.38 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.73 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  31.65 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  35.38 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  35.92 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.2 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.58 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  32.73 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  34.64 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  30.22 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  31.61 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.91 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  31.76 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  27.91 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  27.81 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  31.94 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  30.19 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>