More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4232 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  56.99 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  55.32 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  53.04 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  56.76 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  50.53 
 
 		 209 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  54.45 
 
 		 271 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  48.28 
 
 		 228 aa  160  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  49.51 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  47.14 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  44.86 
 
 		 267 aa  158  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  44.9 
 
 		 250 aa  154  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  49.08 
 
 		 298 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  48.65 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  51.52 
 
 		 299 aa  148  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  46.59 
 
 		 265 aa  148  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  44.9 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  42.86 
 
 		 217 aa  147  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  48.4 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  48.4 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  56.35 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  50.53 
 
 		 278 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  47.85 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.5 
 
 		 224 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.93 
 
 		 264 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  48.53 
 
 		 222 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  57.14 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  44.21 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.45 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  55.37 
 
 		 208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  49.51 
 
 		 232 aa  131  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  43.33 
 
 		 235 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.5 
 
 		 261 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  41.05 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  44.44 
 
 		 212 aa  121  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 		 218 aa  121  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  39.57 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  45.32 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.45 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  36.96 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.61 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.14 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  30.73 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  38.31 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  32.16 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  37.98 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  34.97 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.4 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  33.58 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  37.35 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  36.11 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  34.57 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.86 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.86 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  35.81 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  33.82 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  41.55 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.36 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  33.08 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  29.27 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  34.72 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  29.27 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  32.87 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.88 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  33.58 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.79 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  36.57 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  34.91 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  36.76 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.57 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  29.27 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.72 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  32.73 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  35.63 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  38.75 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.01 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  37.12 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>