More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4434 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  100 
 
 		 174 aa  346  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  55.17 
 
 		 224 aa  180  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  52.6 
 
 		 176 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6428  GrpE protein  58.82 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  50.32 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  48.67 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.46 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.43 
 
 		 204 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 185 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  43.28 
 
 		 198 aa  97.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  38.1 
 
 		 260 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  39.57 
 
 		 192 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  39.57 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 200 aa  95.5  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 195 aa  94.4  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 198 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  38.41 
 
 		 210 aa  92.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  41.5 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 212 aa  91.3  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  32.2 
 
 		 195 aa  91.3  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  39.16 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  40.28 
 
 		 201 aa  90.9  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  35.23 
 
 		 210 aa  90.5  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.97 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  31.64 
 
 		 195 aa  89  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 		 206 aa  88.6  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  31.35 
 
 		 200 aa  88.6  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 184 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 203 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  34.09 
 
 		 187 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  35.51 
 
 		 200 aa  87.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  29.82 
 
 		 210 aa  87.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 		 209 aa  87.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  35 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  34.35 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  34.35 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.35 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 206 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 206 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 206 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 194 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 		 208 aa  85.1  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 206 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  37.66 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 		 209 aa  84.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  36.96 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 		 189 aa  84.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  30.59 
 
 		 194 aa  84.3  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  39.13 
 
 		 203 aa  84.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 		 196 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 		 196 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 		 241 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 		 196 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 		 250 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  31.61 
 
 		 193 aa  84  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.69 
 
 		 207 aa  84  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  30.66 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  33.96 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  33.79 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  36.57 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.75 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  30.43 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.75 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  35.09 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  31.51 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  31.51 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  37.98 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  34.12 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  31.51 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  33.08 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  33.57 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  30.87 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  28.86 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  37.04 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  36.23 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  33.09 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  34.09 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  32.88 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>