More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00570 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  100 
 
 
179 aa  352  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  48.39 
 
 
224 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  48.25 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6428  GrpE protein  45.91 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  41.46 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  48.12 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.94 
 
 
210 aa  94.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.12 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  37.25 
 
 
156 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
242 aa  92  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.42 
 
 
260 aa  91.3  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  34.53 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  35.57 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  39.1 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  36.88 
 
 
190 aa  87.4  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  38.26 
 
 
161 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.82 
 
 
190 aa  84.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  30.51 
 
 
184 aa  84.3  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  28.74 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  40 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  40.46 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.66 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  34.53 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.14 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  32.22 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  32.12 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  32.62 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  33.33 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  30.34 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  32.16 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  34 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  32.16 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  33.78 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  30.56 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  28.75 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  32.21 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  30.41 
 
 
208 aa  79  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  32.64 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  38.06 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  31.91 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  29.73 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  28.75 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  32.14 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  30.88 
 
 
200 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  31.82 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  29.95 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  40 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  35 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  39.39 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  35 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  29.28 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  29.28 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  29.28 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  34.83 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  27.27 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  29.28 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  29.28 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  32.48 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  32.89 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  32.54 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  37.78 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  32.54 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.33 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.46 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.33 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  32.86 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  28.66 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 
209 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  32.87 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  27.84 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  28.76 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  28.76 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  31.88 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  28.76 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  28.26 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.97 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  28.76 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  30 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  30 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  28.9 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  30 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  30 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  30 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  34 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  30 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  28.76 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  29.14 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  30 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  30.19 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>