More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3590 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  100 
 
 		 177 aa  350  8e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  62.59 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  50.32 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6428  GrpE protein  48.3 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  50.32 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.25 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  41.29 
 
 		 161 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  38.51 
 
 		 260 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  35.67 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 213 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  39.44 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  35.97 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  34.44 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 205 aa  92  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.81 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  39.57 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  28.25 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  44.78 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  33.51 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.18 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  39.29 
 
 		 282 aa  89  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  37.02 
 
 		 200 aa  87.8  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.42 
 
 		 198 aa  87.4  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  32.57 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  30.94 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  33.76 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  35.71 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.32 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  37.41 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  32.35 
 
 		 209 aa  84.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  34.35 
 
 		 221 aa  84.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.67 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.62 
 
 		 213 aa  84.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 201 aa  84.3  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 206 aa  84  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 		 208 aa  84  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 		 208 aa  84  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  38.56 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  39.44 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  38.57 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.67 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  40.58 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.46 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  32.2 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  37.74 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.73 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.15 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  33.8 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  31.16 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  36.36 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.06 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.53 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  38.57 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  38.67 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  38.67 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.04 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  38 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  35 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  36.6 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  36.69 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  34.75 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  37.98 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  33.57 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34.75 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  32.82 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  34.75 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  34.97 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  35.29 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  32.53 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  34.75 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  31.36 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  32.09 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>