More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6428 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6428  GrpE protein  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  58.82 
 
 		 174 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  64.44 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  48.3 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  49.71 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  55 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.91 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  44.76 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  39.71 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  38.17 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  34.84 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  37.16 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  36.5 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  39.29 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.09 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  36.43 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  39.53 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.64 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.51 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  35.82 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  31.62 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  32.43 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  35.25 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  31.91 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  31.58 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.62 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  28.9 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  36.42 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  32.65 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.78 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  32.58 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.29 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  33.33 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  30.99 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  31.16 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  36.17 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  42.67 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  34.07 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  32.85 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.53 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  31.88 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  30.05 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  32.17 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  38.52 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  35.62 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  29.8 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  33.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  33.78 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  31.69 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  34.03 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  29.11 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  30.22 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  27.54 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  32.79 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.07 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  27.34 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  30.69 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  29.59 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  35.62 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  32.62 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  32.09 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.09 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  30.68 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  29.12 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  29.44 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  32.17 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  33.15 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  31.48 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  28.78 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  32.41 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  34.72 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  31.82 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  36.15 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  36.3 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  36.73 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  35.25 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>