More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0427 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  71.35 
 
 		 184 aa  249  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  46.45 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.81 
 
 		 260 aa  99  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.69 
 
 		 217 aa  98.6  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  39.79 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  32.6 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  39.86 
 
 		 156 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.81 
 
 		 282 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.55 
 
 		 208 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  33.9 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  37.01 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  37.96 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  35.12 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  35.97 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  35.42 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  36.36 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  38.16 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.56 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.57 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  35.92 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  36.03 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.78 
 
 		 248 aa  89.4  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.84 
 
 		 225 aa  88.2  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.31 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  35.75 
 
 		 189 aa  87.8  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  34.09 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  36 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  32.58 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  36.02 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.43 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  32.61 
 
 		 208 aa  85.1  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  32.96 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  31.03 
 
 		 150 aa  84.7  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  34.78 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  32.78 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.33 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  34.22 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  30.22 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  37.28 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  32.19 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  34.64 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.34 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  35.86 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.94 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.91 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  33.79 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  34.42 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  34.57 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  34.29 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  33.1 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  35.03 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  34.97 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  30.51 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  33.66 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  34.09 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  31.64 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  36.55 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  34.93 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  34.22 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  32.43 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  30.12 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  34.09 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  32.16 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  30.17 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  33.16 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  35.53 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  30.82 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  38.93 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  35.4 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  33.33 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  33.78 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  30.9 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.8 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  31.58 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.56 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  30.77 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  31.72 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.28 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  33.79 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>