More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1643 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  44.26 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  44.32 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  49.32 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  49.66 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  47.68 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  46.67 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  45.89 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  45.21 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  47.02 
 
 		 169 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.64 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  41.61 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.67 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  37.72 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  36.36 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 184 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  37.24 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  33.69 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  42 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.55 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.75 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  39.31 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  35.23 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  35.85 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.91 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  35.85 
 
 		 230 aa  101  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  33.16 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  37.87 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  36.09 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.26 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  36.09 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  33.93 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  35.98 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  38.67 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  36.9 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  41.38 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  35.14 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.57 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  38.13 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  38.13 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.21 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  38.13 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  34.86 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 241 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  35.96 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  39.04 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.29 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 196 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 196 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 196 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 250 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.63 
 
 		 202 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  37.71 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  33.86 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.39 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  36.46 
 
 		 210 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  41.48 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  33.68 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  32.88 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  32.04 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  37.76 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 222 aa  95.5  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>