More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0936 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 169 aa  336  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  69.49 
 
 		 175 aa  231  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  67.42 
 
 		 176 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  66.29 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  48.09 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  49.1 
 
 		 194 aa  158  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  53.74 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  47.47 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  48.15 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  48 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  40.94 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.79 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  43.14 
 
 		 228 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  41.83 
 
 		 230 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  45.93 
 
 		 198 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  40.34 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  41.83 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.04 
 
 		 222 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  42.14 
 
 		 245 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  45.33 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  40.34 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  40.76 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.79 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  45.99 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  46.72 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  41.89 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  41.89 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.54 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  45.26 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  45.26 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  45.26 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  45.26 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  45.26 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  45.26 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  42.38 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  45.26 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  46.72 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  46.72 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  40.94 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 194 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  45.59 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  45.99 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  39.08 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.82 
 
 		 202 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.26 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.82 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  45.21 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  42.07 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  45.99 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  42.07 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  45.99 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  39.64 
 
 		 222 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  45.26 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  36 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  40.14 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  41.1 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  38.61 
 
 		 206 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.26 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  36.57 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  38.42 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  37.29 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  38.42 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  38.42 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  38.42 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  38.42 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  38.42 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  37.29 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  38.42 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  38.32 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  34.27 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  39.86 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  37.85 
 
 		 188 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 213 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  37.64 
 
 		 192 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  34.3 
 
 		 195 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  37.64 
 
 		 192 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  37.64 
 
 		 192 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  42.57 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  39.61 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  35 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  39.77 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  42.86 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  41.89 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>