More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2006 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 208 aa  413  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  98.08 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  47.83 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  46.26 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  46.78 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  41.94 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  41.89 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  45.38 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  36.76 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  40.94 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  43.24 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  42.68 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  36.47 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.32 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  36.47 
 
 		 185 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  38.1 
 
 		 180 aa  102  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  41.01 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  41.04 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  38.78 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 184 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  42.42 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  37.85 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  38.61 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  43.48 
 
 		 361 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.91 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  43.26 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.35 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  34.19 
 
 		 173 aa  98.6  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  36.55 
 
 		 185 aa  98.6  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  38.96 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  42.54 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  33.99 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.87 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  37.24 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  33.69 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  41.13 
 
 		 410 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.65 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 178 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  39.53 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  43.18 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.22 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  35.47 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  41.26 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  41.26 
 
 		 176 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.41 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>