More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2312 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  46.98 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  39.89 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  45.64 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  40.99 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 188 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 188 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 188 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 188 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 188 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  45.04 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  44.2 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.26 
 
 		 190 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  45.65 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  36.22 
 
 		 192 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  43.51 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  44.44 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  46.26 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  43.94 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  35.87 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.98 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  37.17 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  37.86 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  35.71 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.52 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  43.17 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  39.57 
 
 		 194 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  31.07 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  38.69 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  41.14 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.14 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  37.93 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  40.51 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  36.49 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 199 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  40.88 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  30.7 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.02 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.6 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  32.69 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  37.16 
 
 		 261 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  37.16 
 
 		 261 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  35.33 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.17 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  36.09 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  36.9 
 
 		 259 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.51 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  35.66 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.91 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  30.64 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  33.1 
 
 		 185 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  31.46 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  33.33 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  29.72 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 		 186 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  33.56 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  36.91 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  35.06 
 
 		 194 aa  92.4  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.34 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  36.36 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  33.82 
 
 		 174 aa  92  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  33.99 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.93 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  36.69 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  28.79 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  36.76 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  39.19 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.92 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  32.88 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  29.45 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  38.24 
 
 		 150 aa  89  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  32.39 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  30.85 
 
 		 205 aa  88.6  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.96 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.03 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  35.34 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  32.62 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  32.86 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.35 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  32.62 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>