More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2014 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  100 
 
 		 361 aa  697    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  76.39 
 
 		 410 aa  348  6e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  58.1 
 
 		 234 aa  193  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1291  GrpE protein  57.25 
 
 		 218 aa  159  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2845  GrpE protein  52.81 
 
 		 219 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 191 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 208 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 208 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.32 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36.97 
 
 		 226 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.94 
 
 		 213 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.42 
 
 		 194 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 195 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.97 
 
 		 231 aa  93.2  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.99 
 
 		 181 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35 
 
 		 225 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  32.64 
 
 		 209 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  34.85 
 
 		 189 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  36.6 
 
 		 204 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  38.2 
 
 		 187 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 222 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 194 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.78 
 
 		 282 aa  87  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  35.16 
 
 		 186 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  34.25 
 
 		 182 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 214 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.48 
 
 		 208 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  35.62 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  37.97 
 
 		 169 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  34.42 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  32.88 
 
 		 182 aa  85.1  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  37.01 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  33.93 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  32.19 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  37.76 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.04 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  33.93 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  34.42 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.59 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.22 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  31.21 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  37.68 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  35.76 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  32.07 
 
 		 226 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 186 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  35.71 
 
 		 187 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  35.22 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  35.57 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  35.77 
 
 		 181 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 178 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  36.88 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  34.42 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  35.57 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  32.9 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.53 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  37.86 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  36.6 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  32.31 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  32.31 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  35.8 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  36.69 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  32.81 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  37.01 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  33.33 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  32.73 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  33.77 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  33.1 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  33.56 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  32.2 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  37.93 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  33.93 
 
 		 207 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 		 181 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.09 
 
 		 192 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  31.76 
 
 		 202 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  32.34 
 
 		 201 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.05 
 
 		 204 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 		 181 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  30.67 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 181 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.76 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  33.74 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  33.52 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.67 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>