More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1291 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1291  GrpE protein  100 
 
 
218 aa  417  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  58.16 
 
 
410 aa  169  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  56.83 
 
 
361 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  49.68 
 
 
234 aa  158  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2845  GrpE protein  44.95 
 
 
219 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198977  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.65 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  34.39 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  34.85 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  30.26 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  36.84 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  31.25 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  36.61 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  27.57 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  33.75 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.43 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  35.26 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  35.44 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.15 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  35.34 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  36.69 
 
 
172 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  29.53 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  35.71 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.11 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  31.72 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  29.53 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  34.97 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  33.57 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.21 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  31.25 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  32.68 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  28.05 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.54 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  28.05 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.52 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  32.16 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  33.76 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  29.53 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  35.26 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  34.46 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 
188 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  32.35 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  36.55 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  33.11 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 
198 aa  72  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.93 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  32.87 
 
 
250 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.93 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  32.09 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  35.66 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  33.93 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  32.53 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  30.91 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  33.83 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  33.33 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  33.56 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  30.67 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  29.82 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  32.39 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  35.88 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.88 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  32.17 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  30.56 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  35.1 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  31.65 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  29.7 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  32.42 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  29.9 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.31 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  32.17 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  32.82 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  28.06 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>