More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1312 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  63.93 
 
 
232 aa  294  7e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  50 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  38.67 
 
 
218 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  46.26 
 
 
199 aa  131  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.92 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  39.04 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  43.31 
 
 
193 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  37.36 
 
 
228 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  42.03 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  43.31 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  43.09 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  43.31 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  42.06 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  41.73 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  35.11 
 
 
235 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.94 
 
 
264 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  42.86 
 
 
267 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  41.27 
 
 
250 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  37.5 
 
 
214 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  40.27 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  35.56 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  35 
 
 
215 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  35 
 
 
215 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  41.35 
 
 
209 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  41.35 
 
 
205 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  36.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  38.85 
 
 
209 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  34.05 
 
 
271 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  37.29 
 
 
217 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.6 
 
 
208 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  30.93 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.37 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  38.84 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  38.25 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  31.22 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  37.12 
 
 
199 aa  88.6  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.66 
 
 
243 aa  88.2  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  29.95 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.24 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  36 
 
 
203 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  30.25 
 
 
191 aa  85.1  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  32.39 
 
 
195 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  31.72 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.79 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.66 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  35.12 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  33.85 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  33.85 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  32.65 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  44.72 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.97 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.1 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.43 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  30.91 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.15 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  32.21 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  35.43 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  33.79 
 
 
238 aa  79  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 
199 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  32.32 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  33.89 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  38.73 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  33.08 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  32.41 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  31.88 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  31.37 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  31.51 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.58 
 
 
246 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  35.17 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  31.03 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.03 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  32.98 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  33.9 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  32.31 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.33 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  32.17 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  29.46 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.69 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  26.82 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  34.93 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  28.96 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  31.69 
 
 
260 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  33.6 
 
 
244 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  35.11 
 
 
200 aa  72  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.09 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  31.43 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>