More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  56.52 
 
 		 193 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  46.43 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  53.52 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  44.86 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  52.52 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  51.82 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  51.47 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  51.85 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  50 
 
 		 265 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.29 
 
 		 224 aa  124  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  46.38 
 
 		 267 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  47.79 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  48.63 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  45.99 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  44.93 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  44.75 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  48.91 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  50.4 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  42.96 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  44.19 
 
 		 298 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  43.75 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  39.68 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.77 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.65 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  41.72 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  41.72 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  39.55 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  43.02 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  40.97 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  43.51 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  39.78 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  43.38 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  35.76 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  38.97 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  34.41 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  39.29 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.03 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.65 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  34.31 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  32.54 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.27 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.46 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.06 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36.59 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  39.29 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  38.73 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.5 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  37.88 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.46 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  30.15 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  39.16 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  32.12 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  35.87 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.51 
 
 		 260 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  34.29 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  42.03 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  34.78 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  30.71 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  30.43 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  32.74 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  36.31 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.07 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  34.29 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  30.81 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.76 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.91 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  33.8 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  34.29 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.23 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  34.59 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  35.19 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.62 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  34.75 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  32.59 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.61 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.71 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  35.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  30.83 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  28.97 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.14 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  33.09 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  35.14 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  36.36 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  33.83 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  32.18 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>