More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0450 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  99.07 
 
 
215 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  99.07 
 
 
215 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  75.25 
 
 
205 aa  300  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  74.04 
 
 
209 aa  297  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  60 
 
 
235 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  50.49 
 
 
214 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  60 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  45.37 
 
 
235 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  42.45 
 
 
218 aa  148  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  48.13 
 
 
217 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  57.48 
 
 
299 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  50.96 
 
 
265 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.27 
 
 
261 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  43.81 
 
 
222 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  47.03 
 
 
193 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  42.31 
 
 
193 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  44.39 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  47.77 
 
 
298 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  40.53 
 
 
240 aa  128  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  43.27 
 
 
271 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  37.81 
 
 
217 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  47.03 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  39.09 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.2 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  39.6 
 
 
250 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  48.33 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  45.71 
 
 
212 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.15 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  37.93 
 
 
209 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  43.07 
 
 
222 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.3 
 
 
188 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  41.67 
 
 
278 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.78 
 
 
224 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  41.55 
 
 
248 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  38.57 
 
 
232 aa  101  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 
218 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  40.29 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 
242 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  39 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.42 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  29.31 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  36.05 
 
 
246 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  39.44 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  37.8 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  37.8 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.29 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  32.83 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  31.28 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  38 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  40.71 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  32.72 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  34.09 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  30.46 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  34.71 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.8 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  31.58 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  36.72 
 
 
286 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  30 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  37.78 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  33.99 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  37.41 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  31.68 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  38.81 
 
 
181 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.62 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  28.65 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  38.28 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  34.11 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  30.67 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.53 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  39.1 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  31.36 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  31.39 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  32.88 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  31.76 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  29.78 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  29.81 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  32.64 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  30.91 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  33.09 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  32.78 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  34.81 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.29 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  33.86 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  33.08 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  36.96 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  34.42 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  33.8 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.25 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>