More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5470 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  100 
 
 		 250 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  56.93 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  53.96 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  49.05 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  47.17 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  58.65 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  44.34 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  45.21 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  45.45 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  44.13 
 
 		 222 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  40.43 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  45 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  42.08 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  52.67 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  49.65 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  51.06 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  45.95 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  43.23 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  38.35 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  38.71 
 
 		 209 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  39.53 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  39.53 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  39.53 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 235 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  41.18 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  38.1 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  37.04 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.56 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  40.62 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  41.27 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.84 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  37.56 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  37.5 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  44.74 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  44.85 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.61 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  37.8 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.45 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.38 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  33.51 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.01 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.77 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  36.15 
 
 		 207 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  32.53 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  28.85 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  30.41 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  34.09 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.33 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  34.56 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.16 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  35.11 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  35.06 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.39 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  36.36 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  30 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.68 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  35.71 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  31.46 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  34.01 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  31.46 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  31.46 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  28.42 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  31.96 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  31.08 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  32.21 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  30.9 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  30.9 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  30.9 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  32.56 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  30.9 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.74 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  29.25 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  34.35 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  30.9 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.5 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  28.14 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  33.76 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  37.69 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  28.14 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  33.76 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.61 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.11 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  31.18 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  32.88 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  29 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  29.73 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  29.94 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  31.08 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  32.2 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  30.37 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>