More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3208 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  64.14 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  52.3 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  50.55 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  47.9 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  54.61 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  49.38 
 
 		 194 aa  157  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  45.41 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  45 
 
 		 191 aa  150  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  38.97 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  37.7 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  44.19 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  42.54 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  39.46 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  40.74 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40.52 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  35.71 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.93 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  40.88 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  39.16 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  38.59 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  35.68 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  37.67 
 
 		 282 aa  98.6  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  30.29 
 
 		 223 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  37.2 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  41.1 
 
 		 169 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  32.96 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  38.17 
 
 		 226 aa  95.9  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  39.71 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  30.94 
 
 		 247 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  36.99 
 
 		 274 aa  95.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  39.6 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  30 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.81 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  34.11 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  32.38 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.23 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.47 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.82 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.47 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  35.68 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  32.28 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  30.48 
 
 		 190 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.51 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  34.1 
 
 		 246 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.29 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  37.5 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  27.47 
 
 		 259 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  36.91 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  32.31 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  29.52 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  35.29 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  32.35 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  32.58 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  34.97 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  35.22 
 
 		 261 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  35.22 
 
 		 261 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  34.75 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  28.64 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.51 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  33.97 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  37.67 
 
 		 175 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.92 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  33.33 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  26.92 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 186 aa  85.1  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  34.51 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  29.56 
 
 		 237 aa  84.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  34.25 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  34.39 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  30.72 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  33.58 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  32.58 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  35.48 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  31.85 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  34.81 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.81 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  29.93 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  33.55 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34 
 
 		 172 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  29.84 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>