More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1053 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  61.15 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  53.75 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  58.7 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  47.06 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  42.07 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  41.91 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  41.91 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  46.92 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  44.03 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.13 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  38.62 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  42.55 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.3 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  39.23 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  36.92 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.92 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.23 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  35.76 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  40.69 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  39.23 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  37.24 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.71 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  37.68 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.17 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.64 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  33.79 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  39.53 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  37.06 
 
 		 260 aa  95.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.84 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 199 aa  94.7  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  36.64 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  41.73 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  36.36 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  37.4 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  38.35 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  36.96 
 
 		 184 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  40.32 
 
 		 298 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  37.69 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  38.85 
 
 		 217 aa  91.3  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  35.93 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  35.93 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  35.93 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  35.51 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  35.51 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  35.43 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  38.17 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.06 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  31.11 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.15 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  34.53 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  35.33 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  40.31 
 
 		 156 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  33.17 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  34.76 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  38.17 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>