More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2551 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  52.41 
 
 		 198 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  43.33 
 
 		 190 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  44.83 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  45.14 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  41.18 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  45 
 
 		 195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  40.94 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  39.56 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  39.56 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 190 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  41.32 
 
 		 186 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.59 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  37.5 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  41.67 
 
 		 189 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  40.51 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  40.12 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  41.14 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  43.4 
 
 		 181 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 		 184 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  41.57 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  37.87 
 
 		 240 aa  122  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 200 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  33.18 
 
 		 198 aa  122  8e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  44.53 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.15 
 
 		 207 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  40.49 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  38.33 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  40.71 
 
 		 210 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  43.4 
 
 		 202 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  42.44 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.71 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.78 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  41.62 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.61 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  44.2 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.76 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  33.49 
 
 		 189 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.48 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  39.06 
 
 		 200 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  41.52 
 
 		 204 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 200 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  40.85 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.14 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.14 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  40.25 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  33.82 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  39.05 
 
 		 187 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  41.91 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  40.25 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  38.55 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  33.66 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  33.82 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.69 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  42 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  37.95 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  39.63 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  33.66 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.94 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  35.45 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 187 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  39.86 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 197 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  35.45 
 
 		 203 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  32.55 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  39.86 
 
 		 187 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.08 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  39.73 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 199 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.71 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.42 
 
 		 192 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  38.1 
 
 		 193 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.53 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  37.57 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.92 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  34.65 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  40.94 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  39.42 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  37.06 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  38.36 
 
 		 194 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>