More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1194 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  74.17 
 
 		 191 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  63.76 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  61.15 
 
 		 207 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  51.88 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  54.96 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  49.62 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  37.44 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  46.21 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  43.61 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.38 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  36.63 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  42.42 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  43.18 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  44.78 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.69 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  40.91 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.64 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  40.85 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  41.96 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  40.85 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  39.57 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  39.57 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  38.64 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  36.84 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  43.17 
 
 		 225 aa  101  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  41.3 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  37.86 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  36.7 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  42.11 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  37.32 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  36.05 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  39.57 
 
 		 189 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  38.06 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 230 aa  98.2  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  40.46 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  37.13 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  36.69 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  35.11 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  37.14 
 
 		 245 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  36.6 
 
 		 181 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 222 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.68 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.35 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.35 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.1 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  39.86 
 
 		 298 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  37.14 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  37.4 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  35 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  36.09 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  34.72 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>