More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0441 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  100 
 
 
209 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  52.88 
 
 
193 aa  174  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  51 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  47.15 
 
 
218 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  44.74 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  45.36 
 
 
193 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  48.17 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.99 
 
 
224 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  40.76 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  53.91 
 
 
208 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  51.91 
 
 
188 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  38.46 
 
 
214 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  40.48 
 
 
278 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  45.77 
 
 
267 aa  122  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  42.05 
 
 
209 aa  121  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  40.39 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  39.59 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  40.39 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  50.36 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  40.72 
 
 
205 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  39.9 
 
 
215 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  39.25 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  40.89 
 
 
235 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.22 
 
 
264 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  43.33 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  38.03 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  43.23 
 
 
299 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.93 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  38.65 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  46.21 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  39.46 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  40.1 
 
 
217 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.95 
 
 
261 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  37.5 
 
 
222 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  37.38 
 
 
232 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  39.26 
 
 
199 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  36.67 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  38.61 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  29.21 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.75 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.24 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  32.89 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  35.97 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  26.86 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.29 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  29.03 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  29.32 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  33.33 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  31.52 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  31.71 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.04 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  34.45 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  30.77 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  35.04 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  33.33 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.69 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  37.7 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  28.57 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  39.18 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  29.48 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  38.24 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  34.45 
 
 
195 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  37.7 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  31.93 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  32.35 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  40.82 
 
 
224 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.92 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  27.61 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  30.89 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  30.95 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  28.32 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  32.65 
 
 
245 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  30.72 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  27.61 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  28.57 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  41.05 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  30.65 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  30.25 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  30.65 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  28.76 
 
 
260 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  30.65 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1772  GrpE protein  29.86 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0802801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  30.25 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  32.72 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  29.08 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>