More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1772 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1772  GrpE protein  100 
 
 
208 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0802801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2068  GrpE protein  87.74 
 
 
212 aa  339  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.84065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2160  GrpE protein  88.68 
 
 
212 aa  338  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2045  GrpE protein  64.71 
 
 
221 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0137125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6858  GrpE protein  40.28 
 
 
312 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0571011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  38.24 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  36.55 
 
 
201 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.33 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.64 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  32.57 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  34.36 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.16 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  34.84 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  41.22 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  34.73 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.99 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  40.38 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  34.81 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  28.33 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  32.48 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.55 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.89 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  40.71 
 
 
244 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  31.95 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  34.27 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  32.95 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  34.66 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  34.66 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  34.64 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  35.22 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  34.38 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  35.59 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  30.56 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  31.25 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.35 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  36.19 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  25.27 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  29.17 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  29.84 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1196  GrpE protein  32.48 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  27.67 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  32.43 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  34.21 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  31.01 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  33.13 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  29.09 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  29.25 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  33.33 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  29.95 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  29.09 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  33.13 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  32.47 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  29.45 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  37.34 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  37.61 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  31.21 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  33.7 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  29.17 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  31.58 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.57 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  35.62 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  31.25 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  35.37 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  36.61 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  29.76 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  28.03 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  28 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  31.82 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  31.21 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  36.36 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  36.3 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  33.16 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  31.52 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  33.85 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  36.53 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  31.37 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  32.94 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.29 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.82 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  30.51 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.91 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>