More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1196 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1196  GrpE protein  100 
 
 
196 aa  388  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.67 
 
 
208 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 
213 aa  104  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  37.4 
 
 
210 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  33.51 
 
 
211 aa  101  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  41.22 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  38.52 
 
 
213 aa  95.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  34.87 
 
 
190 aa  94.7  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  31.41 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  36.59 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.56 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  35.22 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  35.22 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  29.34 
 
 
190 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.15 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  32.06 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  36.23 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  36.73 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  30.46 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  31.34 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.29 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  35.71 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.51 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  29.58 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  30.2 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  32.21 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.33 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  32.87 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  31.88 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  34.36 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  33.81 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  28.48 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  28.86 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  34.88 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  33.56 
 
 
240 aa  78.2  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  29.53 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  29.27 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.91 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  28.57 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  29.05 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  31.29 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  27.85 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  33.56 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  28.48 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  24.46 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  36.76 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.39 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  34.62 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  31.58 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  30.46 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  32.61 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  32.89 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  28.76 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.43 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  29.53 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  28.19 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  31.33 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  29.17 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  25.14 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  35.44 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  30 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  28.05 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  34.88 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  27.88 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  28.85 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.01 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  32.45 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  31.33 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  27.44 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6858  GrpE protein  29.89 
 
 
312 aa  74.7  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0571011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  28.91 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  26.54 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  27.54 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  29.35 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  31.22 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  26.2 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  31.64 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  26.21 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  31.29 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  30.94 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  30.41 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>